Yeniçeri Ocağının kaldırılımasının doğuracağı sorunların farkında olan III. Selim Nizam-ı Cedit adlı bir ordu kurdu ve bu ordunun geliştirlimesi için Avrupa’dan Subaylar getirtti. Tüm bu reform hareketlerinin harcamalarının karşılanması için ise İrad-ı Cedit adlı ayrı bir hazine kurdu yeni vergiler koydu. III Selim’in bu yenilikçi hareketleri ve kurduğu yeni örgütler o güne kadar devleti çıkarları için kullanmaya alışmış ve ıslahat hareketleriyle bu çıkarlarını kaybetmiş olan yeniçerileri Kabakçı Mustafa başkanlığında ayaklandırmıştı. Yeniçeriler Nizam-ı Cedit’in kaldırılmasını istiyorlardı. Kan dökülmesine karşı olan III. Selim bu ocağı kaldırdı. Bundan cesaret alan yeniçeriler yöneticilerden on kişinin kendilerine verilmesini istediler, bunu da elde edince Şeyhülislam'dan padişahı tahttan indirmek için fetva alıp Mustafa IV.’yü Selim III.’nün yerine tahta geçirdiler. Ayaklanamdan kurtulan bazı kişiler bu durumu Rusçuk ayanı Alemdar Mustafa Paşa’ya bildirdiler. Alemdar adamlarını göndererek boğazları tutmuş olan Kabakçı’yı öldürdüler .Fakat bu durumu haber alan IV. Mustafa Selim ve Mahmut’u öldürmek için emir verdi.II.Mahmut ölümden kurtuldu fakat IV. Mustafa nin adamları Selim III.’yü öldürdü. Buna çok üzülen Alemdar IV. Mustafa‘yı tahttan indirip yerine II.Mahmut‘u tahta geçirdi. II.Mahmut da III. Selim‘in başlatmış olduğu bu reform hareketlerine devam ederek yeniçeri ocağını kaldırdı. İleriyi gören yenlikçi bir padişah olmasının yanısıra müzik ve edebiyatla da uğraşırdı. III.Selim‘in cenazi büyük bir törenle kaldırılarak Lalei Camii’nin yakınındaki türbeye gömüldü.
